Флаг МОУ «Лицей № 50» представляет собой прямоугольное полотнище двух цветов: белого и синего цвета с отношением ширины к длине 1:3, в левом верхнем углу расположен герб Лицея № 50.
Синий цвет ― символ чести, благородства, духовности, небесных просторов. Белый цвет ― символ духовной чистоты.
Герб
На голубом поле изображен Земной шар в руках детей, на фоне Земного шара изображена надпись «Галактика 50».
Сверху имеется надпись: МОУ «Лицей № 50», снизу – Саратов.